ZAKŁAD DIAGNOSTYKI LABORATORYJNEJ I IMMUNOLOGII KLINICZNEJ WIEKU ROZWOJOWEGO – STRUKTURA ZAKŁADU
Zakład Diagnostyki Laboratoryjnej i Immunologii Klinicznej Wieku Rozwojowego mieści się w budynku Dziecięcego Szpitala Klinicznego im. Józefa Polikarpa Brudzińskiego w Warszawie w Bloku 2H i 2G.
Zakład pełni rolę laboratorium diagnostycznego Dziecięcego Szpitala Klinicznego (DSK) – numer identyfikacyjny w Ewidencji Laboratoriów Krajowej Rady Diagnostów Laboratoryjnych – 1513. W strukturze ZDL wyodrębniono Działy diagnostyczne obejmujące poszczególne Pracownie specjalistyczne:
Dział Immunologii Transfuzjologicznej i Bank krwi - 2H
| Pracownia Immunologii Transfuzjologicznej – 2H.012 tel. 22 317 94 79 |
Bank krwi – 2H.011 tel. 22 317 95 12, fax 22 317 95 12 |
Wykaz wykonywanych badań:
- Określanie grupy krwi ABO i RhD;
- Przeglądowe badanie na obecność przeciwciał odpornościowych do antygenów krwinek czerwonych;
- Próba zgodności serologicznej;
- Wykonywanie badań w kierunku konfliktu w układzie ABO w diagnostyce choroby hemolitycznej noworodka,
- Badanie kwalifikujące do podania immunoglobuliny anty-D w ramach profilaktyki konfliktu serologicznego RhD.
Wyposażenie Pracowni i Banku krwi:
Analizator immunohematologiczny Innova AutoVue, system immunohematologiczny Ortho BioVue – półautomat, urządzenia chłodnicze, wirówki, inkubator z wytrząsarką do płytek krwi, urządzenia do suchego rozmrażania osocza i krioprecypitatu Sahara
Skład Zespołu
Kierownik Działu Immunologii Transfuzjologicznej i Banku krwi
mgr Małgorzata Skrzypczak-Pamięta
diagnosta laboratoryjny, specjalista laboratoryjnej diagnostyki medycznej, specjalista laboratoryjnej transfuzjologii medycznej
e-mail: malgorzata.skrzypczak-pamieta[at]uckwum.pl
bank.krwi[at]uckwwum.pl
dr Wioleta Żarlak
diagnosta laboratoryjny, specjalista laboratoryjnej diagnostyki medycznej, w trakcie specjalizacji z laboratoryjnej transfuzjologii medycznej
mgr Grażyna Szlaga
diagnosta laboratoryjny, specjalista laboratoryjnej diagnostyki medycznej
mgr Olga Kowal
diagnosta laboratoryjny, specjalista laboratoryjnej transfuzjologii medycznej
Dział Immunologii - 2H/2G
| Pracownia Białek – 2H.031 tel. 22 317 95 03 |
Pracownia cytometryczna- 2H.033 tel. 22 317 95 05 |
Pracownia Hodowli komórkowej- 2H.040 tel. 22 317 95 05 |
Wykaz wykonywanych badań:
- Badania z wykorzystaniem metody cytometrii przepływowej:
- ocena immunofenotypu komórek szpiku: panel białaczkowy i panel podstawowy;
- ocena podstawowych subpopulacji limfocytów krwi obwodowej (T, B, NK, Tpomocnicze, Tcytotoksyczne, NKT) – wartości procentowe oraz wartości bezwzględne;
- ocena limfocytów B (CD19/CD20);
- ocena aktywacji limfocytów T (markery HLA-DR, CD69, CD25);
- ocena limfocytów T pomocniczych i T cytotoksycznych oraz stosunek CD4/CD8 w popłuczynach pęcherzykowo-oskrzelikowych (BAL);
- badania w kierunku HLH: ocena ekspresji perforyny, test degranulacji komórek NK, test cytotoksyczny (z komórkami K562);
- badania w kierunku sferocytozy wrodzonej: Test EMA , Test oporności osmotycznej;
- ocena ekspresji CD34 we krwi obwodowej.
- Test wykrywający latentne zakażenie prątkami gruźlicy metodą ELISA – Quantiferon TB Gold.
Wyposażenie Pracowni Działu Immunologii
Pracownia cytometrii, hodowli komórkowej, białek oraz pokój mikroskopowy wyposażone są w nowoczesny sprzęt diagnostyczno-badawczy: cytometr przepływowy FACS Lyric, cytometr przepływowy FACS Canto II, cytometr przepływowy LSR Fortessa, mikroskop fluorescencyjny Leica DMi8, mikroskopy optyczne (w tym mikroskop konsultacyjny), mikroskop kontrastowo-fazowy, inkubatory z regulowaną wilgotnością i zawartością CO2, chemiluminometr, komory laminarne, fluorymetr BMG Omega FluoSTAR, termocykler do amplifikacji DNA, aparat LightCycler do RT-PCR, zestaw do elektroforezy, aparaty do badania metodą ELISA, homogenizator ultradźwiękowy, łaźnię wodną, wytrząsarki laboratoryjne oraz wirówki laboratoryjne. Pracownia genetyki wyposażona jest w aparaturę do analizy mikromacierzy, sekwencjonowania metodą Sangera i termocyklery.
Skład Zespołu:
dr hab. n. med. Anna Stelmaszczyk-Emmel
diagnosta laboratoryjny, specjalista laboratoryjnej diagnostyki medycznej, specjalista laboratoryjnej hematologii medycznej
dr n.med. Elżbieta Górska
diagnosta laboratoryjny, specjalista zdrowia publicznego
dr n.med. Katarzyna Popko
diagnosta laboratoryjny, specjalista laboratoryjnej immunologii medycznej
dr n.med. Iwona Kotuła
diagnosta laboratoryjny, analityk kliniczny, w trakcie specjalizacji z laboratoryjnej diagnostyki medycznej
dr n. med. Aneta Manda-Handzlik
diagnosta laboratoryjny
mgr Adrianna Cieloch
diagnosta laboratoryjny
Dział Genetyki Medycznej - 2G
| Pokój asystentów Genetyki 2H.002 tel. 22 317 94 78 |
Pracownia Sekwencjonowania 2G.058 |
Pracownia Mikromacierzy 2G.056 tel. 22 317 95 09 |
Pracownia PCR 2G.059 tel. 22 317 95 15 |
Wykonywane badania:
- sekwencjonowanie metodą Sangera
- sekwencjonowanie wysokoprzepustowe (NGS)
- porównawcza hybrydyzacja genomowa do mikromacierzy (aCGH)
- multipleksowa amplifikacja sond zależna od ligacji (MLPA)
- metylo-specyficzna multipleksowa amplifikacja sond zależna od ligacji (MS-MLPA)
- Real-Time PCR
- Sekwencjonowanie metodą Sangera
Technika ta pozwala na analizę krótkich fragmentów sekwencji (średnio ok. 600 pz) celem identyfikacji wariantów pojedynczego nukleotydu (SNV) lub niewielkich zmian typu InDel (delecji lub duplikacji kilku nukleotydów). Jako obszar zainteresowania podawany jest zazwyczaj fragment genomu przewidziany do badania, np. określony ekson (-y) wraz z określoną sekwencją otaczającą lub konkretna pozycja wariantu zgodnie z nomenklaturą HGVS, jak w przypadku weryfikacji wyników NGS.
- Sekwencjonowanie następnej generacji (Next Generation Sequencing – NGS)
Technika umożliwia identyfikację germinalnych wariantów punktowych oraz niewielkich delecji i duplikacji w obrębie kodujących fragmentów (eksonów) wybranych genów, wykrywanych przez panel sond oligonukleotydowych. W porównaniu do klasycznego sekwencjonowania Sangera NGS jest metodą wysokoprzepustową – daje możliwość analizy sekwencji wielu genów jednocześnie.
Ze względu na olbrzymią ilość wariantów otrzymywanych z badania NGS bardzo istotny jest precyzyjnie określony kierunek badania oraz dokładny wywiad rodzinny. Ponadto ze względu na wysokie koszty badania zalecamy przemyślane kierowanie pacjentów na badanie, najlepiej poprzedzone konsultacją z lekarzem genetykiem klinicznym.
Wykonywane panele genów z wykorzystaniem techniki NGS:
– Panel kardiologiczny (174 geny powiązanych z chorobami układu sercowo-naczyniowego);
– Eksom kliniczny (ponad 4800 genów powiązanych z fenotypem klinicznym wielu chorób genetycznych);
– Zaprojektowany panel genów w kierunku diagnostyki następujących chorób: stwardnienie guzowate, fakomatozy, schwannomatoza, osteogenesis imperfecta, anemia Fanconiego, zespół CMMRDS (MLH1, MSH2/6, PMS2) i inne.
W razie zainteresowania sekwencjonowaniem większej grupy pacjentów celem diagnostyki różnicowej, prosimy najchętniej o kontakt osobisty, ew. telefoniczny lub mailowy.
- Porównawcza hybrydyzacja genomowa do mikromacierzy (aCGH)
Umożliwia wykrywanie wariantów liczby kopii (delecje i duplikacje fragmentów genomowego DNA obejmujące eksony, całe geny lub większe fragmenty chromosomów) oraz braku heterozygotyczności bez zmiany liczby kopii w genomowym DNA.
Metoda aCGH polega na hybrydyzacji mieszaniny badanego DNA i DNA referencyjnego do nośnika (mikromacierzy) w postaci szkiełka podstawowego, na którym w znanej kolejności naniesione są oligonukleotydy, czyli krótkie sekwencje DNA obejmujące cały genom człowieka.
Nasza pracownia posiada certyfikat diagnostyki in vitro (IVD) oraz kontroli zewnątrzlaboratoryjnej GenQA.
- Multipleksowa amplifikacja sond zależna od ligacji (MLPA)
Umożliwia identyfikację wariantów liczby kopii (delecji i duplikacji) w regionach genomu człowieka reprezentowanych przez zastosowany zestaw sond poszukujący zmian w zidentyfikowanych miejscach genomu przy podejrzeniu konkretnych jednostek chorobowych. W zależności od kierunku badania dostępne są różne panele MLPA. Do najczęściej wykonywanych należą m.in. MLPA P245 (zespół DiGeorge’a, zespół Williamsa oraz inne zespoły mikrodelecyjne), P241 (cukrzyca typu MODY), P036/P070 (regiony subtelomerowe chromosomów), P319 (choroby tarczycy).
- Metylo-specyficzna multipleksowa amplifikacja sond zależna od ligacji (MS-MLPA)
Identyfikacja wariantów liczby kopii (delecji i duplikacji) oraz nieprawidłowości we wzorze metylacji w regionach genomu człowieka reprezentowanych przez zastosowany zestaw sond poszukujący zmian w zidentyfikowanych miejscach genomu przy podejrzeniu konkretnych jednostek chorobowych. W zależności od kierunku badania dostępne są różne panele MLPA. Do najczęściej wykonywanych należą m.in. MLPA ME-030 (zespół Beckwitha-Wiedemanna i Silvera-Russella) oraz ME-028 (zespół Pradera-Willi’ego i Angelmana).
Sprzęt i aparatura medyczna
Dział Genetyki Medycznej UCML dysponuje nowoczesnym sprzętem laboratoryjnym: sekwenator kapilarny Genetic Analyzer, sekwenator następnej generacji MiSeq, skaner do mikromacierzy Sure Scan Dx G5761AA firmy Agilent Technologies z piecem hybrydyzacyjnym G2545A, aparat do Real-Time PCR Light Cycler 480 II firmy Roche, termocyklery, spektrofotometr do pomiaru w kropli Nano Drop One, system do zdjęć żeli z kamerą GelDoc firmy Bio-Rad, wirówki, urządzenia chłodnicze, zamrażarka niskotemperaturowa
ZAKRES DZIAŁALNOŚCI:
Praca Działu Genetyki Medycznej UCML koncentruje się głównie na diagnostyce postnatalnej chorób i zespołów uwarunkowanych genetycznie, przede wszystkim pacjentów z niepełnosprawnością intelektualną, wrodzonymi wadami i dysmorfią, z chorobami rzadkimi i ultra rzadkimi. Laboratorium specjalizuje się w badaniach pacjentów z dziedzicznymi chorobami serca, neurofibromatozą i stwardnieniem guzowatym.
Współpracujemy z oddziałami klinicznymi UCK WUM oraz Poradnią Genetyczną dla dzieci i dorosłych (DSK UCK WUM), w której przyjmują lekarze specjaliści genetyki klinicznej:
prof. dr hab. med. Lech Korniszewski
dr hab. n. med. Krzysztof Szczałuba
dr n. med. Dorota Gieruszczak-Białek
dr n. med. Agata Skórka
Badania genetyczne wykonywane w Dziale Genetyki Medycznej UCML podlegają kontroli wewnątrz- i zewnątrzlaboratoryjnej. Jedną z metod oceny jakości wykonywanych badań genetycznych jest udział w międzynarodowej kontroli prowadzonej przez Europejską Agencję Kontroli Jakości Badań Genetycznych (Genomics Quality Assessment – GenQA) Załączniki certyfikatów:
Certyfikat 1
Certyfikat 2
Certyfikat 3
NAUKA I DYDAKTYKA:
W Dziale Genetyki Medycznej UCML istnieje możliwość odbycia stażu podstawowego i staży kierunkowych w ramach specjalizacji z laboratoryjnej genetyki medycznej oraz praktyk studenckich, a także wykonania prac magisterskich i prac doktorskich.
Wykonujemy badania w ramach NFZ oraz komercyjne.
AKTUALNA OFERTA BADAŃ NA ROK 2020
JAK ZLECIĆ BADANIE W RAMACH NFZ?
Na stronie głównej Intranetu DSK wybieramy zakładkę PROCEDURY I INSTRUKCJE, następnie DZIAŁ GENETYKI
na dole strony wybieramy ostatni załącznik zal 2&3do LA.PO.G.01 SKIEROWANIE NA BADANIE GENETYCZNE I ŚWIADOMA ZGODA
Wykonanie badania genetycznego możliwe jest tylko po prawidłowym wypełnieniu skierowania (2 STRONY) oraz świadomej zgody (2 STRONY). Szczególnie zwracamy uwagę na podpisy lekarza zlecającego (z pieczątką) oraz rodziców/opiekunów prawnych.
JAK WYKONAĆ BADANIE KOMERCYJNE?
- należy pobrać formularz skierowania i deklaracji świadomej zgody na postnatalne badanie genetyczne (pliki do pobrania)
- wypełnić pobrane formularze i podpisać
- zgłosić się do rejestracji głównej Szpitala (na parterze w holu głównym Szpitala) – od 8.00 do 10.00 od poniedziałku do piątku
- zgłosić się do Punktu Pobrań Polikliniki DSK – Gabinet zabiegowy 056.0H (parter)
- opłacić za badanie – Kasa DSK (parter, w lewo po wejściu do Szpitala). Odpłatność za wykonanie badań wg „ Cennika Usług Medycznych’’ obowiązującego w DSK w Warszawie
- odbiór wyniku – UCML – gabinet nr 002 – od 8.00 do 15.00 od poniedziałku do piątku Czas oczekiwania na wynik badań genetycznych – informacja w Załączniku nr 1 do LA.PO.DO.01 – Wykaz badań laboratoryjnych.
Przygotowanie pacjenta do postnatalnych badań genetycznych:
Materiałem do postnatalnych badań genetycznych są limfocyty krwi żylnej. Należy pobrać krew obwodową do probówki morfologicznej na EDTA.
Pacjent nie wymaga specjalnego przygotowania, nie musi być na czczo.
Instrukcje pobrania i transportu materiału do badań genetycznych:
Na stronie głównej Intranetu DSK wybieramy zakładkę PROCEDURY I INSTRUKCJE, następnie DZIAŁ GENETYKI wybieramy odpowiedni załącznik: Procedura pobierania materiału do badań genetycznych i Procedura transportu materiału.
Skład Zespołu
Kierownik Działu Genetyki Medycznej UCML
dr n. med. Dorota Czapczak
diagnosta laboratoryjny, specjalista laboratoryjnej genetyki medycznej
tel. 22 317 94 78
e-mail: dorota.czapczak[at]uckwum.pl
Asystenci:
mgr Marta Kazek diagnosta laboratoryjny
mgr Agnieszka Mroczek diagnosta laboratoryjny
mgr Jakub Pepłowski diagnosta laboratoryjny
mgr Katarzyna Siewiera diagnosta laboratoryjny, specjalista laboratoryjnej immunologii medycznej
mgr Karolina Skubisz diagnosta laboratoryjny
mgr Ewelina Witkowska diagnosta laboratoryjny
mgr Sylwia Wróblewska-Kabba diagnosta laboratoryjny, specjalista laboratoryjnej genetyki medycznej