Klinika Chirurgii Dziecięcej, Urologii Dziecięcej i Pediatrii założona w 1950 roku jest najstarszym w Polsce oddziałem Chirurgii Dziecięcej. Wykształceni w niej i wyszkoleni lekarze objęli następnie oddziały w całym kraju. Założycielem Kliniki był profesor Jan Kossakowski – twórca specjalności, I Prezes Polskiego Towarzystwa Chirurgów Dziecięcych i I Specjalista Krajowy w tej dziedzinie. Następnie Kliniką kierowali: prof. Irena Giżycka, prof. Krystyna Wysocka i prof. Aleksander Wagner. Od 2005 roku kierownikiem Kliniki jest prof. Andrzej Kamiński.
Oddział Kliniczny dysponuje 40 łóżkami w dwóch oddziałach: dla dzieci powyżej lub poniżej 5 lat z wyodrębnionymi dwiema salami dla intensywnego nadzoru nad noworodkami. Sale pacjentów są jedno lub dwuosobowe. Przy każdym łóżku pacjenta znajduje się rozkładany fotel dla opiekuna, który zapewnia możliwość całodobowej opieki nad dzieckiem. Do dyspozycji rodziców są dwa w pełni wyposażone pokoje socjalne, szafki do przechowywania bagażu oraz łazienki z prysznicem.
Zespół lekarski Oddziału Klinicznego stanowi 11 specjalistów Chirurgii Dziecięcej, 2 specjalistów Urologii Dziecięcej, 1 specjalista Chirurgii Plastycznej, 1 specjalista Pediatrii oraz 6 rezydentów. Zespół pielęgniarski tworzy 30 pielęgniarek.
W 2018 roku w Oddziale Klinicznyme hospitalizowano 2500 pacjentów, u których wykonano 1620 zabiegów operacyjnych. 7500 pacjentów leczono ambulatoryjnie w Poradni Chirurgicznej i Urologicznej.
Zakres działalności leczniczej:
Chirurgia Noworodka – zespół Oddziału Klinicznego zajmuje się leczeniem wad wrodzonych i chorób noworodkowych, w tym wrodzonej niedrożności przełyku, wrodzonej przepukliny przeponowej, wrodzonej niedrożności odbytu, wrodzonych wad powłok, wrodzonych wad płuc, wrodzonych wad przewodu pokarmowego, chorób w obrębie klatki piersiowej i jamy brzusznej – we współpracy z Oddziałem Położniczym, Oddziałem Noworodkowym i Oddziałem Intensywnej Terapii .
Chirurgia płuc, tchawicy i oskrzeli – zespół Oddziału Klinicznego zajmuje się leczeniem wad wrodzonych i chorób płuc we współpracy z Oddziałem Pulmonologii i Laryngologii.
Chirurgia przewodu pokarmowego – zespół Oddziału Klinicznego zajmuje się leczeniem wad i chorób przewodu pokarmowego: przełyku, żołądka, jelit, wątroby, dróg żółciowych, trzustki we współpracy z Oddziałem Gastroenterologii.
Chirurgia onkologiczna – zespół Oddziału Klinicznego zajmuje się leczeniem guzów litych wątroby, nadnerczy, nerek, trzustki i jelit we współpracy z Oddziałem Onkologii.
Chirurgia endokrynologiczna – zespół Kliniki zajmuje się leczeniem wad i chorób tarczycy, przytarczyc, trzustki i nadnerczy we współpracy z Oddziałem Endokrynologii.
Chirurgia urazowa – zespół Oddziału Klinicznego zajmuje się leczeniem urazów klatki piersiowej i jamy brzusznej z najcięższymi urazami wątroby, śledziony, trzustki , nerek, jelit i naczyń we współpracy z Oddziałem Neurochirurgii, Ortopedii, Chirurgii Naczyniowej i Intensywnej Terapii.
Urologia – zespół Oddziału Klinicznego zajmuje się leczeniem wad i chorób dróg moczowych we współpracy z Oddziałem Nefrologii.
Chirurgia plastyczna – zespół Oddziału Klinicznego zajmuje się leczeniem wad i chorób plastycznych.
Chirurgia małych wad wrodzonych i chorób – zespół Oddziału Klinicznego zajmuje się leczeniem najczęstszych wad i chorób: przepuklin, wodniaków jądra, żylaków powrózka, wnętrostwa, stulejki.
Chirurgia ostrodyżurowa – zespół Oddziału Klinicznego zajmuje się leczeniem ostrodyżurowych chorób: zapalenia wyrostka robaczkowego, wgłobienia jelit, niedrożności, skrętów jajnika, jądra, przydatków jądra.